Sodyum azid (NaN3) özellikle nokta mutasyon çalışmalarında yoğun olarak kullanılan kimyasal bir mutajendir. Bu çalışmada, Finola altı sıralı arpa çeşidi, kimyasal bir mutajen olan sodyum azid ile muamele edilerek 14 adet mutant arpa hattı elde edilmiştir. Elde edilen hatlar arasındaki genetik farklılık, 5 adet basit tekrarlı diziler arası polimorfizm (Inter Simple Sequence Repeat, ISSR) markörü yardımıyla belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre 5 ISSR marköründen 24 adet bant elde edilmiş ve bu bantlardan 18 adet polimorfik allel belirlenmiş ve ortalama polimorfizm oranı %76.33 olarak saptanmıştır. Ortalama allel sayısı 4.8 olup, 6 bant ile UBC-808 en fazla bant üreten primer olurken, en az bant üreten primerler ise 4’er bant ile UBC-820 ve UBC-825 primerleri olmuştur. Kullanılan markörlere ait ortalama polimorfizm bilgi içeriği (PIC) 0.83 olarak hesaplanmış ve PIC değeri 0.78 ile 0.86 aralığında değişmiştir. Markör verileri dendrogramda 2 ana grup oluşturmuştur. Birinci kümede Fnl-4, Fnl-8, Fnl-10, Fnl-11 ve Fnl-12 mutantları yer alırken, ikinci kümede ise Finola çeşidi ile birlikte diğer mutant hatlar yer almaktadır. Temel bileşenler analizi, Finola çeşidi ve mutant hatlardan Fnl-5, Fnl-13 ve Fnl-14 hatlarının birbirine benzemekle birlikte, bazı alleller bakımından farklı olduklarını ortaya koymuştur.
Sodium azide (NaN3) is widely used as a chemical mutagen in mutation studies, especially to induce point mutations. This study was carried out to determine genetic diversity of six-rowed barley cultivar Finola and 14 mutant lines induced by sodium azide mutagenesis agent and identified by using 5 Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. According to the results, 24 bands were produced by five ISSR markers, 18 of them were found polymorphic, and the average polymorphism rate was 76.33%. The average allele number was determined as 4.8, and UBC-808 marker had the highest allele number with 6 alleles, while UBC-820 and UBC-825 markers had the lowest allele numbers with 4 alleles. The average polymorphism information content of the markers used in the study was 0.83, and ranked from 0.78 to 0.86. A dendogram was created using marker data, and according to the dendogram, genotypes were divided into two main groups. Fnl-4, Fnl-8, Fnl-10, Fnl-11 and Fnl-12 mutants existed in the first group, while the others including Finola cultivar were in the second group. Based on the principal component analysis (PCA), Finola cultivar and mutant lines Fnl-5, Fnl-13 and Fnl-14 were evaluated as they are similar to Finola although, differed for some alleles.
Primary Language | tr |
---|---|
Subjects | Science |
Journal Section | Research Articles |
Authors |
|
Dates |
Publication Date : June 1, 2020 |
Bibtex | @research article { derim630502,
journal = {Derim},
issn = {1300-3496},
eissn = {2149-2182},
address = {},
publisher = {Batı Akdeniz Agricultural Research Institute},
year = {2020},
volume = {37},
pages = {27 - 32},
doi = {10.16882/derim.2020.630502},
title = {Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi},
key = {cite},
author = {Güngör, Hüseyin and Akbudak, Mehmet Aydın and Fi̇li̇z, Ertuğrul and Yüce, İlker and Dumlupınar, Ziya}
} |
APA | Güngör, H , Akbudak, M , Fi̇li̇z, E , Yüce, İ , Dumlupınar, Z . (2020). Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi . Derim , 37 (1) , 27-32 . DOI: 10.16882/derim.2020.630502 |
MLA | Güngör, H , Akbudak, M , Fi̇li̇z, E , Yüce, İ , Dumlupınar, Z . "Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi" . Derim 37 (2020 ): 27-32 <http://www.derim.com.tr/en/pub/issue/52496/630502> |
Chicago | Güngör, H , Akbudak, M , Fi̇li̇z, E , Yüce, İ , Dumlupınar, Z . "Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi". Derim 37 (2020 ): 27-32 |
RIS | TY - JOUR T1 - Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi AU - Hüseyin Güngör , Mehmet Aydın Akbudak , Ertuğrul Fi̇li̇z , İlker Yüce , Ziya Dumlupınar Y1 - 2020 PY - 2020 N1 - doi: 10.16882/derim.2020.630502 DO - 10.16882/derim.2020.630502 T2 - Derim JF - Journal JO - JOR SP - 27 EP - 32 VL - 37 IS - 1 SN - 1300-3496-2149-2182 M3 - doi: 10.16882/derim.2020.630502 UR - https://doi.org/10.16882/derim.2020.630502 Y2 - 2020 ER - |
EndNote | %0 Derim Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi %A Hüseyin Güngör , Mehmet Aydın Akbudak , Ertuğrul Fi̇li̇z , İlker Yüce , Ziya Dumlupınar %T Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi %D 2020 %J Derim %P 1300-3496-2149-2182 %V 37 %N 1 %R doi: 10.16882/derim.2020.630502 %U 10.16882/derim.2020.630502 |
ISNAD | Güngör, Hüseyin , Akbudak, Mehmet Aydın , Fi̇li̇z, Ertuğrul , Yüce, İlker , Dumlupınar, Ziya . "Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi". Derim 37 / 1 (June 2020): 27-32 . https://doi.org/10.16882/derim.2020.630502 |
AMA | Güngör H , Akbudak M , Fi̇li̇z E , Yüce İ , Dumlupınar Z . Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi. DERİM. 2020; 37(1): 27-32. |
Vancouver | Güngör H , Akbudak M , Fi̇li̇z E , Yüce İ , Dumlupınar Z . Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi. Derim. 2020; 37(1): 27-32. |
IEEE | H. Güngör , M. Akbudak , E. Fi̇li̇z , İ. Yüce and Z. Dumlupınar , "Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi", Derim, vol. 37, no. 1, pp. 27-32, Jun. 2020, doi:10.16882/derim.2020.630502 |